님의 경우에는 뭐라고 답변을 해야 모르겠지만 역시 SCSI컨트롤러 와 RAID를 사용해 봤기 때문에
조금 적어 봅니다.

우선은 SCSI 컨트롤러를 먼저 셋팅합니다. 카드를 꽂고 윈도우즈 드라이버도 다 잡아줍니다.
그에따른 부속 장비도 설치합니다. (님에 가지고 계신 스캐너등등)
물론 이 과정에서 터미네이션이 꼭 이루어 져 있어야 합니다.
대개 SCSI컨트롤러가 터미네이션, ID 할당을 자동으로 하게 되겠지만, 꼭 터미네이션 하는 부분에서
문제가 생기더군요. 케이블 끝에 끼워지는 마지막 장비에 대해서 "Termination On" 을 지정해 주어야
한다는 애기입니다. SCSI 장비를 살펴보시면 "Ter" 이라고 버튼이나 갭 끼우는 부분이 있을겁니다.
해당 부품 자사 홈페이지에 들어가 보시면 자세하게 나와있으니 참고하셨으면 좋겠군요.

또하나, RAID 카드도 어찌보면 스카시 컨트롤러는 아니지만 컴은 그렇게 인식하더둔요.
그래서 두개의 카드를 동시에 사용할 경우 SCSI ID가 문제가 됩니다. SCSI 카드는 대개 SCSI ID3 내지는 5번을 자동으로 할당합니다. 만약 RAID 카드와의 번호가 같다면 부팅이 되지 않습니다.
요 번호는 수동으로 셋팅이 가능하니 ID가 충돌되지 않나 확인해 보시고 맞다면 수동으로 SCSI 카드의
ID를 번경해 주시면 될겁니다.